Le collège collabore étroitement avec les représentants des principales organisations étudiantes, notamment le SYREL-IMG (Syndicat représentatif lyonnais des internes en médecine générale), investies dans la promotion de la médecine générale.

Le CLGE a ainsi contribué à l’organisation du congrès annuel de l’ISNAR-IMG (InterSyndicale Nationale Autonome Représentative des Internes de Médecine Générale) à Lyon en 2013.

Il a subventionné chaque année l’école automnale deFAYR-GP (French Association of Young Researchers in General Practice) qui a lieu à Lyon.